Фамилия Акимен — редкий случай, когда разбор упирается не столько в суффикс, сколько в отсутствие привычного окончания. В русской модели фамилий на -ин, -ов, -ский здесь финаль -ен. Это сразу указывает на то, что перед нами не исконно русская, а украинская или белорусская фамилия, причём оформленная по модели, характерной для западных регионов бывшей Речи Посполитой. Суффикс -ен в украинских фамилиях часто стоит в позиции, где русский язык дал бы -ин: например, украинское Гриценко соответствует русскому Гришин, а Акимен — Акимин.

Основа фамилии — просторечная форма крестильного имени Иоаким. В народном произношении оно утратило начальный слог и превратилось в Аким. От Акима образовали уменьшительное Акима, а от него — притяжательное прилагательное с суффиксом -ен: Акимен, то есть «чей? — Акимен сын». Получается, что фамилия означает «потомок Акима» или «сын Акима». В русских говорах такая же форма дала бы фамилию Акимин, а украинский вариант Акимен закрепился в написании без финального -ко, что встречается реже, чем типичные фамилии на -енко.

Есть и вторая, менее очевидная версия. В южнорусских и украинских говорах «акимен» могло быть прозвищем человека, который постоянно употреблял частицу «аки» (как, словно) или говорил «аки мены» — то есть «как я, по-моему». Такие прозвища по характерным словечкам в старину давали охотно: вспомните фамилии типа Таков, Таковский. Однако эта гипотеза слабее: прозвище с частицей «аки» скорее дало бы форму Акин или Акаев, а не Акимен. Поэтому основная версия — от имени Аким — остаётся наиболее правдоподобной.

Географически фамилия Акимен тяготеет к Черниговской и Полтавской областям Украины, а также к юго-западным районам Беларуси. В России она встречается единично, чаще всего у потомков переселенцев с Украины. Сословной привязки нет: носителями могли быть и крестьяне, и казаки, и мещане — фамилия не содержит указаний на титул или профессию. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок нынешних Акименов носил имя Аким и жил на территории, где в XVII–XVIII веках активно формировались украинские фамилии на -ен.