Фамилия Акимочкины образована от имени собственного, а точнее — от просторечной формы канонического мужского имени Иоаким. В переводе с древнееврейского языка это имя означает «прославленный богом». В русской народной среде длинное и непривычное для уха церковное имя Иоаким быстро переделали в более удобные для произношения варианты: Аким, Яким и, в уменьшительно-ласкательной форме, Акимочка. Именно от этого прозвания, Акимочка, и пошла фамилия.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Если разобрать конструкцию, то «Акимочкин» буквально означает «чей?» — «сын Акимочки» или «потомок Акимочки». Такой тип фамилий (от уменьшительных имён на -ка/-очка) очень распространён, но именно форма с суффиксом -очк- встречается реже, чем стандартные -ов/-ев, что делает её более характерной для определённых регионов или семейной традиции именования.

О точном месте и времени возникновения фамилии Акимочкины сейчас говорить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян и мещан растянулся на несколько столетий и завершился в основной массе лишь к концу XIX века. Однако можно с уверенностью сказать, что предки современных Акимочкиных были людьми простого сословия: в дворянской среде предпочитали полные, книжные формы имени, а не домашние «Акимочка». Фамилия эта — не просто набор букв, а живое свидетельство того, как народная речь перерабатывала церковные каноны, создавая свои, тёплые и привычные имена.