Фамилия Аксаненко — яркий пример украинской модели образования фамилий на -енко. В украинской ономастике суффикс -енко традиционно означал «сын» или «потомок», поэтому Аксаненко буквально переводится как «сын Аксана». В основе фамилии лежит личное имя Аксан, которое является разговорной или диалектной формой канонического имени Ксенофонт.

Ксенофонт — греческое имя, означающее «чужой голос» или «чужеземный голос». В народной среде имя подверглось сокращению и упрощению: отпал начальный слог «Ксе-», и осталась основа «Аксан». Такая утрата первого слога — типичное явление для восточнославянской адаптации длинных греческих имен (сравните: Евстафий → Остап, Ксения → Аксенья). В украинском языке имя Аксан фиксируется в исторических документах XVI–XVII веков, особенно на территории Черниговщины и Полтавщины.

География фамилии Аксаненко почти полностью сосредоточена в Украине, с наибольшей плотностью в центральных и северных областях — Сумской, Полтавской, Черкасской. Это неудивительно: суффикс -енко был особенно распространен в казацкой среде Левобережной Украины, где фамилии часто фиксировали принадлежность к роду по отцу. Носитель фамилии Аксаненко мог быть потомком казака или крестьянина, чьего отца звали Аксан.

Интересно, что у фамилии есть близкие «родственники» — Аксаненков, Аксанюк, Аксанов. Первая форма встречается на территории России, куда фамилию принесли переселенцы с Украины, заменив украинский суффикс на русский -ов. Аксанюк, напротив, сохранил западноукраинский суффикс -юк, что указывает на возможное происхождение с Волыни или Подолья. Таким образом, Аксаненко стоит в центре небольшого, но показательного гнезда фамилий, объединенных редким именем-основой.