Фамилия Аксентий (а также её варианты Аксентьев, Аксенов) происходит от крестильного имени Авксентий. В переводе с древнегреческого «авксанно» означает «растущий», «увеличивающийся». В русской традиции имя Авксентий, как и многие другие церковные имена, подверглось сокращению — начальный слог «Ав» отпал, и в обиходе имя закрепилось как Аксентий. Это одна из тех редких фамилий, которые в неизменной форме сохранили исходное имя. Обычно такие фамилии получали, если имя было одновременно и прозвищем, или в случае, когда фамилия оформлялась не через типичные суффиксы -ов/-ев, а напрямую, как, например, у фамилий Гаврила или Фома.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Большинство русских фамилий на -ий (Григорий, Василий) переходили в фамилию через суффикс притяжательности: Григорьев, Васильев. Фамилия же Аксентий застыла в именительном падеже, что встречается реже и характерно для западнорусских земель (Белоруссия, Украина) или для позднего оформления фамилий у духовенства и крестьянства. В среде духовенства такие фамилии могли давать семинаристам прямо по имени святого, без добавления суффикса, что делало их своеобразным «паспортом» происхождения.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования фамилий был длительным и неравномерным. Тем не менее, фамилия Аксентий — это не просто указание на предка по имени Аксентий, но и свидетельство того, как церковное имя, пройдя через устную народную традицию, закрепилось в качестве родового прозвания, став памятником славянской письменности и культуры.