Фамилия Алдонов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. В основу фамилии Алдонов легло имя Алдон - производная мужского крестильного имени Евдоким, которое в переводе с древнегреческого означает «славный, окруженный почетом». Скончался Евдоким в возрасте тридцати трех лет. Вскоре после его смерти начались чудотворения от его мощей, что возвестило о его святости. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Алдон, со временем получил фамилию Алдонов. О точном месте и времени возникновения фамилии Алдонов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Алдонов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.