Фамилия Алдунин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. В основу фамилии Алдунин легло имя Алдуня - производная мужского крестильного имени Евдоким, которое в переводе с древнегреческого означает «славный, окруженный почетом». Скончался Евдоким в возрасте тридцати трех лет. Вскоре после его смерти начались чудотворения от его мощей, что возвестило о его святости. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Алдуня, со временем получил фамилию Алдунин. О точном месте и времени возникновения фамилии Алдунин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Алдунин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.