Фамилия Алферов (и её вариант Алфёров, который встречается не реже) происходит от крестильного имени Елевферий. В переводе с греческого оно означает «свободный, достойный быть свободным». Имя пришло на Русь вместе с христианством в X веке и дало множество народных, упрощённых форм. Одна из них — Алфер (или Алфёр) — и стала основой фамилии.

Святым покровителем имени считается священномученик Елевферий Иллирийский, епископ, пострадавший в Риме при императоре Адриане. В православном календаре его память приходится на 15 (28) декабря.

Словообразовательная модель здесь классическая: суффикс -ов указывает на принадлежность. Алферов — буквально «сын Алфера», «потомок человека по имени Алфер». Такая модель была самой распространённой на Руси при формировании фамилий.

Часть Алферовых принадлежала к нетитулованному дворянскому роду Российской империи и Малороссии. Герб этого рода внесён в девятую часть «Общего гербовника дворянских родов». Это говорит о том, что среди носителей фамилии были люди, владевшие землями и состоявшие на государственной службе.

Среди известных однофамильцев — Николай Федорович Алферов (1780–1840), русский архитектор и гравёр, участвовавший в строительстве Казанского собора в Петербурге. В XX веке фамилию прославили физик Жорес Иванович Алферов, лауреат Нобелевской премии, и актриса Ирина Ивановна Алферова, народная артистка России.

В написании фамилии есть одна особенность. В XIX — начале XX века буква «ё» часто заменялась на «е» в документах, поэтому одна и та же семья могла записываться то как Алфёровы, то как Алферовы. Сегодня оба варианта считаются нормативными, но в официальных бумагах стоит сверяться с записью в паспорте.