Фамилия Алганов начинается с неожиданного поворота: она звучит по-тюркски, но её корни, скорее всего, русские и северные. Вопреки первому впечатлению, ключ к разгадке лежит не в степях, а в реках Архангельской области.

Словообразовательная модель указывает на суффикс «-ан-», который в русской ономастике часто закреплял за человеком прозвище по месту жительства — от названия реки, озера или села. Основа «Алг-» с большой вероятностью восходит к гидрониму Алга — реке в бассейне Северной Двины. Человека, жившего на этой реке, могли прозвать Алга́н, то есть «житель с Алги», а его потомки уже стали Алгановыми. Эта версия надёжнее всего, потому что объясняет, почему фамилия встречается в основном на Русском Севере и в Сибири (куда переселялись поморы): она привязана к конкретному географическому очагу.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза. Она связывает фамилию с древнерусским некалендарным именем Алга. Такие имена давали по поведению или внешности. В этом случае Алга могло означать «крикливый», «шумный» или «певун» — от диалектного глагола «алгать» (кричать, петь). Однако речная версия выглядит убедительнее: она опирается на реальную топонимику, а не на гипотетическое прозвище.

По социальному составу Алгановы — это, скорее всего, потомки государственных или монастырских крестьян, а также поморов. Дворянских родов с такой фамилией в истории не зафиксировано. Фамилия редкая, не попавшая в массовые справочники, что только подтверждает её локальное происхождение из одного северного очага.