Фамилия Альтапова — женская форма, а мужская, Альтапов, образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов. Основа «Альтап» необычна: в ней нет очевидного славянского или тюркского корня. Скорее всего, фамилия возникла из прозвища или имени, записанного на слух.

Разбираем основу. Вероятнее всего, это искажённое русским ухом арабское или тюркское имя. Например, имя Альтаф (от арабского «доброта, благосклонность») могло в просторечии получить приращение «-п»: Альтап. В тюркских языках есть слово «алтын» (золото), но до «Альтап» оно сокращается редко. Ещё одна версия — от тюркского «алтап» (наступать, перешагивать), но как личное прозвище это маловероятно.

Географически фамилия редкая. Встречается преимущественно в Поволжье и на Южном Урале, где исторически сильны татарские и башкирские корни, а также среди казахских родов. Это косвенно подтверждает тюрко-мусульманское происхождение основы. Первый носитель фамилии — человек по имени или прозвищу Альтап, чьи потомки получили фамилию по отцу: «чей?» — Альтапов.

Если отбросить редкие варианты, наиболее правдоподобная версия: Альтапов — русифицированная форма тюркского имени Альтаф, где конечный «-ф» перешёл в «-п» из-за оглушения в русской речи. Такой переход не редкость: сравни фамилии Сайтапов (от Сайтаф), Батапов (от Батаф). Фамилия не дворянская и не крестьянская в привычном понимании — она из среды служилых татар, тептярей или башкир, переходивших в оседлость и получавших фамилии по отцу.

Итог: Альтапова — фамилия с тюркской основой, скорее всего восходящая к имени Альтаф, записанному русскими писцами. Носители её — потомки людей, живших на стыке культур, где имя подстраивалось под чужую фонетику, а фамилия закрепляла это звучание.