Фамилия Аминжонов — одна из тех, что чётко указывает на восточные, а точнее — среднеазиатские корни. Её основа — личное мужское имя Аминжон, которое в тюркской и персидской среде складывается из двух частей. Первая, «Амин», арабского происхождения, означает «верный», «честный», «надёжный»; в исламской традиции это один из эпитетов пророка Мухаммеда. Вторая часть, «жон» (от персидского «джан» — душа, жизнь), в именах играет роль ласкательно-уважительного суффикса, примерно как «дорогой» или «любимый». Получается «Аминжон» — «верная душа» или «честный человек», имя-пожелание.

Русский суффикс -ов, добавленный к основе, — классический способ адаптации нерусских фамилий в документах Российской империи и СССР. Такая модель массово применялась при записи населения Средней Азии: к местному имени просто пришивали русское фамильное окончание, указывающее на принадлежность роду. Поэтому Аминжонов буквально значит «потомок Аминжона» или «из семьи Аминжона». Фамилия могла оформиться в конце XIX — первой половине XX века, когда шла активная паспортизация в Узбекистане, Таджикистане и соседних регионах.

Интересно, что в отличие от многих русских фамилий, образованных от крестильных имён, здесь мы видим не церковный, а исламский антропонимикон. Встречается и вариант написания через «а» — Аминджонов, но Аминжонов распространённее. Географически фамилия тяготеет к Ферганской долине, Самарканду и Ходженту, хотя носители разбросаны по всему бывшему СССР. Сословного значения у неё нет: в дореволюционной Средней Азии фамилий как таковых у большинства населения не было, поэтому Аминжоновы — это не дворяне и не купцы, а люди, получившие фамилию при советской власти от имени деда или отца.