Фамилия Ананин восходит к церковному мужскому личному имени Ананий, точнее к его просторечной форме Ананя. Ананий в переводе с древнееврейского означает «отмеченный милостью Божией». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ананя, со временем получил фамилию Ананин.