Фамилия Ананина восходит к церковному мужскому личному имени Ананий, точнее к его производной форме Ананя. Имя Ананий в переводе с древнееврейского языка означает «отмеченный милостью Божией». Скорее всего, основатель рода Ананиных был человеком из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ананя, со временем получил фамилию Ананина.