Прозвище Ананья восходит к аналогичному диалектному слову со значением «ласковый, льстивый человек». Следовательно, это прозвище указывало на особенности характера предка. Маловероятно, что в основе фамилии Ананьин лежит каноническое мужское имя Ананий, которое в переводе с древнееврейского означает «отмеченный милостью Божией». Несмотря на то, что в старину это имя было широко распространенно в крестьянской среде, фамилии, образованные от имени Ананий, звучат как Ананьев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Ананья, со временем получил фамилию Ананьин.