Фамилия Ананньев восходит к каноническому мужскому имени Ананий, которое в переводе с древнееврейского языка означает «отмеченный милостью Божией». В этом случае фамилия Ананнев была образована от прозвища Ананий, которое указывало на особенности характера человека. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ананний, со временем получил фамилию Ананньев.