Фамилия Андиржанова — редкий случай, когда географическое название почти наверняка легло в основу родового имени, причём не через название города, а через этноним. Корень «андижан» отсылает к узбекскому городу Андижан (исторический центр Ферганской долины). Но если бы предок был просто «из Андижана», фамилия скорее звучала бы как Андижанов. Суффикс -жан- здесь не случаен: в тюркских языках «жан» (джан) — «душа», «милый», распространённый компонент личных имён (например, Андижан-бай, Андижан-бек). Значит, Андиржанова образована от личного тюркского имени Андиржан — прозвища или ласкательной формы, где «андир» может быть диалектным искажением «андижан» (человек из Андижана) или самостоятельным корнем.

Вероятнее всего, фамилия сформировалась в среде татар, башкир или казанских служилых людей, где была распространена модель с суффиксом -ов/-ев и тюркской основой. Женская форма Андиржанова указывает, что мужской вариант — Андиржанов. Встречаемость фамилии крайне низкая, в основном фиксируется в Поволжье и на Урале, что совпадает с ареалом расселения татарских и башкирских родов, нёсших службу в XVI–XVIII веках.

Словообразовательная модель проста: тюркское имя Андиржан + русский патронимический суффикс -ов (чей? — Андиржанов). Фамилия не дворянская, не крестьянская в классическом смысле — скорее всего, её носили представители служилого сословия или торговых людей, контактировавших со Средней Азией. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные тюркские основы с компонентом «жан» описаны как типичные для татарского ономастикона, но конкретно «Андиржан» — редкий вариант, не попавший в массовые справочники.

Отдельно стоит отметить, что написание через «д» (Андиржанова, а не Андижанова) — не ошибка, а устойчивый диалектный или письменный вариант. В тюркских говорах звонкие согласные часто выпадают или заменяются, а «р» могло появиться как вставной звук для удобства произношения. Таким образом, фамилия — живой лингвистический след: в ней сплелись узбекский топоним, татарское имяобразование и русская патронимия.