Фамилия Андрушин — редкий случай, когда суффикс «-ин» работает не по стандартной модели. В русских фамилиях «-ин» обычно присоединяют к основам, оканчивающимся на -а или -я: Петя → Петин, Илья → Ильин. Но в основе Андрушин лежит имя, которое и так заканчивается на согласный — Андруш. Это краткая, народная форма крестильного имени Андрей, распространённая в юго-западных русских землях и в Белоруссии. Здесь суффикс «-ин» выполняет ту же роль, что и «-ов»: он означает «сын Андруша», то есть сын человека, которого в быту звали Андруш.

Такая форма имени возникла из польского или украинского влияния, где уменьшительные имена часто получали окончание -уш: Андруш, Михал, Петрусь. На русском Севере или в центральных областях от Андрея скорее образовали бы Андрюшин или Андреев. Андрушин же — фамилия с чётким западнорусским или белорусским следом. Она органично вписалась в общероссийскую модель на «-ин», но сохранила диалектную основу. В ономастике фамилии на «-ин» от имён, оканчивающихся на согласный, встречаются реже и почти всегда указывают на диалектную или иноязычную основу. Унбегаун в своей «Русской фамилии» отмечает, что подобные формы характерны для зоны контакта русского и польского языков.

Версия, что фамилия могла произойти от прозвища Андруша (по аналогии с Андрюша), менее вероятна: такое прозвище дали бы человеку, а не его сыну напрямую. Кем могли быть предки? Скорее всего, простым крестьянином или мещанином из западных губерний Российской империи — Смоленской, Могилёвской, Витебской. Фамилия не дворянская и не купеческая по происхождению: её образовали от обиходного имени, без прибавки «-ский», которая часто маркировала шляхту или духовенство. Андрушин — фамилия человека, которого в деревне звали попросту Андруш, и это прозвище закрепилось за его потомками.