Фамилия Аникна — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но корень сразу ставит в тупик. На первый взгляд кажется, что перед нами женская форма фамилии на -ина, но это не так. Фамилия Аникна — мужская, и её основа не «Аник», а «Аникн». В русском языке такое сочетание согласных на стыке морфем встречается нечасто, и именно оно даёт ключ к разгадке.

Вероятнее всего, фамилия образована от имени Аникий, точнее — от его просторечной формы. Каноническое имя Аникий (из греческого «аникетос» — «непобедимый») в народе превращалось в Аникей, а от него — в Аника. Фамилия Аникна могла возникнуть как стяжённый вариант притяжательного прилагательного: «чей?» — Аникин, но в говорах, где редуцированные гласные «выпадали», форма «Аникин» могла сократиться до «Аникна». То есть изначально было прозвище или отчество «Аникна» (сын Аники), которое закрепилось как фамилия.

Вторая, менее вероятная версия — связь с диалектным словом «аника» (в некоторых говорах — «плакса» или «неудачник»). Однако для фамилии Аникна это объяснение слабее: прозвище «Аникна» звучит как уже готовое отчество, а не как прямое прозвище. К тому же имя Аникий было широко распространено в крестьянской среде, и уменьшительная форма «Аника» встречалась повсеместно.

Географически фамилия тяготеет к северу и северо-западу России — Архангельской, Вологодской, Новгородской областям. Именно там чаще фиксировались формы с выпадением гласного в суффиксе. Носители фамилии Аникна, скорее всего, потомки крестьян или посадских людей, чьи предки носили имя Аника. В документах XVII–XVIII веков можно встретить варианты «Аникнов» и «Аникин», но написание «Аникна» — редкий пример того, как живая речь застыла в официальной записи.