Фамилия Апаницина — женская форма фамилии Апаницин, и её разбор стоит начать с суффикса. Суффикс -ин в русских фамилиях указывает на принадлежность: Апаницин буквально значит «сын Апаницы» или «человек из рода Апаницы». Это типичная модель для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин столь же распространены, как на -ов на юге.

Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Апаница. Скорее всего, это уменьшительная форма от имени Апанас (просторечный вариант Афанасия) или от Апанасий. В русских говорах «апанас» и «апанасий» — это народные варианты греческого имени Афанасий, означающего «бессмертный». Суффикс -ица придаёт уменьшительно-ласкательный оттенок, как в словах «водица», «сестрица». Таким образом, Апаница — это ласковое прозвище человека по имени Афанасий, вроде «Афоня» или «Фаня».

Есть и другая версия, менее вероятная, но допустимая для южных областей. В украинском и белорусском языках «апана» или «пана» может означать «барин» или «пан». Апаница тогда — это прозвище, данное в насмешку или иронию: «маленький пан» или «барин наоборот». Однако для фамилии Апаницина, судя по суффиксу -ин, более характерна северная или центральная русская традиция, где основой чаще служило личное имя, а не социальный статус.

Географически фамилия Апаницин (и её женская форма) встречается в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — то есть в зоне древнего новгородского влияния. Это косвенно подтверждает версию об имени Афанасий: новгородцы часто использовали уменьшительные формы на -ица. Предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище по имени отца или деда. Никаких документальных подтверждений дворянского происхождения у этой фамилии нет.

Таким образом, Апаницина — это фамилия, образованная от разговорной формы имени Афанасий, с типично русским суффиксом принадлежности. Она говорит о том, что предок носителя был Апаницей — «маленьким Афанасием», и это прозвище закрепилось за родом.