Фамилия Апаницина — женская форма, которую разбирают через мужскую основу Апаницин. Суффикс -ин здесь указывает на принадлежность: «сын Апаницы» или «человек из рода Апаницы». Это модель, характерная для северных и центральных регионов России, где фамилии на -ин так же привычны, как на -ов на юге.

Основа — прозвище или неканоническое имя Апаница. Скорее всего, это уменьшительная форма от имени Апанас (просторечный вариант Афанасия) или от Апанасий. В русских говорах «апанас» и «апанасий» — народные варианты греческого имени Афанасий, означающего «бессмертный». Суффикс -ица придаёт ласкательный оттенок, как в словах «водица», «сестрица». По сути, Апаница — это ласковое прозвище человека по имени Афанасий, вроде «Афоня» или «Фаня».

Есть и другая версия, менее вероятная для этой фамилии. В украинском и белорусском языках «апана» или «пана» может означать «барин» или «пан». Тогда Апаница — прозвище, данное в насмешку: «маленький пан» или «барин наоборот». Но суффикс -ин тянет фамилию к северной или центральной русской традиции, где основой чаще служило личное имя, а не социальный статус. Поэтому версия с Афанасием выглядит правдоподобнее.

География подтверждает эту догадку. Фамилия Апаницин (и её женская форма) встречается в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях — зоне древнего новгородского влияния. Новгородцы часто использовали уменьшительные формы на -ица, так что Апаница органично вписывается в эту традицию. Предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвище по имени отца или деда. Дворянского происхождения у фамилии нет — документальных подтверждений этому не обнаружено.

Коротко: Апаницина — фамилия от разговорной формы имени Афанасий, с типично русским суффиксом принадлежности. Предок был Апаницей — «маленьким Афанасием», и это прозвище закрепилось за родом.