Фамилия Аполлонина — яркий пример того, как редкое личное имя перешло в фамильное прозвание и закрепилось в русской ономастике. Она образована от мужского имени Аполлон, которое пришло из древнегреческой мифологии и означает «солнечный», «блистающий». В русской традиции это имя появилось вместе с христианством, но в отличие от Ивана или Петра осталось редким: его давали в основном в среде духовенства или в семьях с высоким уровнем образования, где ценили античную культуру.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Аполлонина в своей основе — это форма притяжательного прилагательного, отвечавшего на вопрос «чей?». Она означает «дочь Аполлона» или «жена Аполлона», если речь о женщине, но в современном понимании это женский вариант фамилии, а мужской — Аполлонин. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имен, оканчивающихся на -а, -я: Аполлон → Аполлонин, как Никита → Никитин или Фома → Фомин.

Географически фамилия Аполлонина встречается крайне редко, что логично для столь нечастого имени-основы. В дореволюционных метрических книгах её можно найти преимущественно в центральных губерниях России, особенно в Москве и Санкт-Петербурге, где было больше священников и разночинцев, дававших детям нестандартные имена. В крестьянской среде эта фамилия почти не бытовала — Аполлонов и Аполлониных там практически нет.

Стоит отметить, что фамилия Аполлонина стоит в ряду с однокоренными Аполлонов и Аполлонский, но различается по суффиксу. Если Аполлонов — чисто патронимическая фамилия на -ов, то Аполлонин — более архаичная форма на -ин, которая часто указывает на более раннее происхождение или на то, что имя-основа воспринималось как склоняемое по типу «Аполлон — Аполлона». В любом случае, носительница этой фамилии может с уверенностью считать, что её предок носил имя древнегреческого бога света и искусств — случай в русской истории нечастый, но запоминающийся.