Фамилия Аполлонина — редкий случай, когда в основе фамильного прозвания лежит имя античного бога. Она образована от мужского имени Аполлон, которое в переводе с древнегреческого означает «солнечный» или «блистающий». В русскую традицию имя попало вместе с христианством, но, в отличие от ходовых Ивана или Петра, осталось штучным: его давали преимущественно в среде духовенства или в образованных семьях, где ценили античную культуру.

Модель образования проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Изначально фамилия отвечала на вопрос «чей?» и означала «дочь Аполлона» или «жена Аполлона», если речь шла о женщине. В современном понимании это женский вариант фамилии, а мужской — Аполлонин. Такая словообразовательная схема типична для русских фамилий от имён, оканчивающихся на -а, -я: Никита → Никитин, Фома → Фомин, Аполлон → Аполлонин.

Географически фамилия встречается крайне редко, что логично для столь нечастого имени-основы. В дореволюционных метрических книгах её можно найти преимущественно в центральных губерниях, особенно в Москве и Санкт-Петербурге — там, где жили священники и разночинцы, дававшие детям нестандартные имена. В крестьянской среде эта фамилия почти не бытовала: Аполлоновых и Аполлониных там практически нет.

Обратите внимание на суффиксальное различие с однокоренными фамилиями. Аполлонов — чисто патронимическая форма на -ов, а Аполлонин — более архаичный вариант на -ин. Эта разница часто указывает на более раннее происхождение или на то, что имя-основа воспринималось как склоняемое по типу «Аполлон — Аполлона». По сути, перед нами архаичная притяжательная форма, которая сохранила память о том, что имя древнегреческого бога света и искусств когда-то склонялось в русском языке как существительное мужского рода с окончанием -а.