Фамилию Аптеев разумнее всего разбирать с корня, а не с суффикса. Основа «аптей» или «апте» восходит к арабскому слову, которое через тюркское посредничество дало русскую «аптеку», но в ономастике закрепилась иначе. В татарской и башкирской среде XVI–XVII веков имя Аптей (варианты — Апты, Аптәй) означало не «аптекарь», а «лекарь», «знахарь» или, по другой трактовке, «открывающий», «дарующий». Так что предок носителя фамилии — не владелец аптеки, а человек, занимавшийся врачеванием травами или заговорами, пользовавшийся за это уважением.

Суффикс «-ев» здесь — чисто русская модель оформления тюркских основ. Так записывали фамилии крещёных татар, башкир и других народов Поволжья при переходе в православие. Если бы фамилия осталась в тюркской среде, она звучала бы как Аптеев или Аптеулы, но с русским окончанием она закрепилась именно в документах после крещения. Встречается и вариант с двойным «е» на конце — это графическая особенность, не меняющая смысла.

Географически фамилия привязана к Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области, а также к местам переселения в Сибирь — Тюменская и Томская области. В дореволюционных переписях Аптеевы числились государственными крестьянами и мещанами, реже купцами. Фамилия встречается и у казанских татар, и у мишарей.

Спорных версий немного. Иногда корень «апт» ошибочно связывают напрямую с греческим, но греческое влияние на русские фамилии в XVI веке минимально. Тюркское посредничество очевидно и подтверждается параллельными фамилиями: Аптекеев, Аптраев, Аптюков — все они от личных имён с тем же корнем.

В XX веке Аптеевы встречаются в самых разных профессиях, но тюркская основа напоминает: предки были связаны с народной медициной — не дипломированной, а той, что передавалась в семье и общине.