Фамилия Аптекашев образована от имени Аптекаш, являющегося диалектным вариантом имени Габдулла. Оно состоит из двух частей: «габд» и «улла». Первая из них берет начало от нарицательного «габде», которое в переводе с арабского языка на русский означает «раб, слуга». Вторая часть имени Габдулла является краткой формой арабского имени арабского Allāh, то есть «бог». Таким образом, именование Габдулла можно трактовать как «слуга Аллаха». Таким образом, потомок человека, которого звали Аптекаш, со временем получил фамилию Аптекашев. Тюркский корень -огло/-оглу/-оглы (в переводе «потомок, сын») типичен для турецких, гагаузских и прочих тюркских фамилий. Так, в источниках упоминается Сагадит Хуснуллинович Аптекашев, родившийся в 1925 году.