Фамилия Аптекаева — редкий случай, когда основа слова указывает на профессию, но не на самого предка, а на его жену. В русской ономастике фамилии на -аев, как правило, образуются от мужских прозвищ или фамилий на -ай (например, Лапша — Лапшаев). В случае с Аптекаевой всё иначе: в основе лежит слово «аптекарь», но не напрямую.

Мужская форма фамилии — Аптекаев. Она образована от прозвища Аптекай. В русских говорах так могли называть человека, который работал в аптеке, торговал лекарствами или просто был сведущ в травах и снадобьях. Но есть и вторая, более точная версия: прозвище Аптекай могли дать мужчине, женатому на аптекарше — женщине, которая сама содержала аптеку или работала в ней. В крестьянской среде XIX века женщина-аптекарь была редкостью, поэтому такое прозвище сразу выделяло семью.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Аптекаев, то есть сын или потомок Аптекая. Фамилия фиксируется преимущественно в южнорусских и поволжских регионах, где в XIX веке активно развивалась земская медицина и появлялись частные аптеки. Встречается она нечасто: по данным современных исследований, носителей фамилии Аптекаевых насчитывается не более нескольких сотен по всей России.

Важно не путать с фамилией Аптекарев — та образована напрямую от слова «аптекарь» с помощью суффикса -ев, без промежуточного прозвища. Аптекаев — это именно «вторичная» фамилия, отражающая не столько занятие самого предка, сколько его семейное положение или прозвище, данное по жене. Такие модели образования — через женскую профессию — встречаются редко, и Аптекаева — один из немногих примеров, сохранивших эту языковую особенность.