Фамилия Ардюкова — женская форма от Ардюков, а та образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, отвечающим на вопрос «чей?» и указывающим на потомка человека по прозвищу Ардюк. Само прозвище, скорее всего, уходит корнями в южнорусские и украинские говоры: «ардюк» или «ордюк» там называли упрямого, своенравного человека, а иногда и медведя. В этом слове слышна связь с тюркским «ардык» (остаток, излишек) или с русским глаголом «артачиться» — упрямиться. Первый носитель прозвища, видимо, выделялся крутым нравом или недюжинной силой.

Есть и другая гипотеза, но она слабее: возводить основу к имени Артемий через народные формы Ардюша или Ардюха. Проблема в том, что от имён фамилии обычно образовывали напрямую с суффиксами -ин или -ов (Артемьев, Артюхов), а форма Ардюк как типичное производное от Артемия не зафиксирована.

География фамилии подтверждает её диалектное происхождение: Ардюковы встречаются в центральных и южных областях России, а также на Украине. По сословной принадлежности предки, вероятнее всего, были крестьянами или однодворцами — в такой среде личное качество или внешность часто становились главным опознавательным знаком человека. В старых документах фамилия могла писаться через «о» — Ордюков, из-за акающего произношения, но смысл от этого не менялся. Сегодня фамилия Ардюкова не редкая, но и не массовая: она держится за конкретное, локальное прозвище, а не за распространённое имя.