Фамилия Атарщикова — женская форма фамилии Атарщиков, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем Атарщик. В основе лежит слово «отарщик» — так в южных говорах называли пастуха, присматривающего за отарой овец. Переход «о» в «а» в начале слова (отара → атара) — характерная черта южнорусского аканья, которая и закрепилась в фамилии.

Само слово «отара» (стадо, чаще овечье) — тюркское заимствование. В казахском языке оtаr означает «пастбище» и «стадо», в татарском utar — «скотный двор». Таким образом, прозвище Атарщик — типичное «профессиональное» именование: предок носителя фамилии был пастухом или владельцем отары. Модель образования фамилии проста: прозвище на -щик → фамилия на -ов (Атарщиков) → женская форма на -а (Атарщикова).

Мужская форма фамилии встречается в истории. Самый известный носитель — Георгий Семёнович Атарщиков (1816–1885), русский генерал, участник Кавказских походов. Его фамилия — того же корня, что указывает на возможное донское или кубанское происхождение рода, ведь именно в казачьих областях юга России скотоводство было основным занятием, а «атарщики» — распространённой профессией.