Фамилия Аубакирова образована от арабского мужского имени Аубакир, которое восходит к двум основам. Первая из них, «ау», является одной из форм имени «Абу», в переводе на русский язык означающего «отец; истинный владелец». Вторая часть — имя Бакир, имеет два значения: «обучающийся, изучающий; достигающий», «рано созревший, быстро выросший». Вероятно, родители, нарекая ребёнка именем Аубакир, желали своему сыну стать мудрым и уважаемым человеком. Среди наиболее известных однофамильцев — Токтар Онгарбаевич Аубакиров (р. 1946), 256-й космонавт мира, 72-й (и последний) космонавт СССР. Первый космонавт казахской национальности. Ныне депутат Мажилиса Парламента Республики Казахстан.