От этого имени было образовано множество разговорных форм, одна из которых — Авдук — и легла в основу данной фамилии. Менее вероятно, что Авдук является уменьшительной формой имени Авдоким (Евдоким), которое в переводе с греческого означает «славный». Библейское имя Авдий имеет древнееврейское происхождение и в переводе с иврита означает «служащий Богу». Скорее всего, основатель рода Авдуковых был выходцем из рабочей или крестьянской семьи. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Авдук, со временем получил фамилию Авдукова.