Фамилия Айбатов происходит от личного мужского имени Айбат, которое восходит к арабскому корню со значением «уважение», «почтение», «достоинство», «авторитет» или «престиж». Имя было распространено в тюркоязычной среде, где арабские заимствования часто становились основой для имён с пожелательной семантикой: нарекая сына Айбатом, родители желали ему стать знатным и всеми почитаемым человеком.

Суффикс -ов указывает на модель образования, характерную для русских фамилий, но в данном случае он присоединился к основе, которая бытовала в среде татар, башкир, ногайцев и других народов, издавна контактировавших с русским языком. Это типичный пример фамилии, возникшей на стыке культур: восточное имя получает русский патронимический формант, который буквально означает «сын Айбата» или «из рода Айбата».

Географически фамилия Айбатов чаще всего встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Татарстане. В этих регионах исламские имена с арабскими корнями были обычны, и после крестьянской реформы или в ходе переписей населения они закреплялись в документах с русскими окончаниями.

В некоторых говорах и диалектах тюркских языков слово «айбат» могло иметь и дополнительные оттенки — например, «величие» или «важность». Однако основное значение остаётся связанным с социальным статусом и моральным авторитетом, что и было заложено в имя как родительское пожелание.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Айбатов, Айбатовский, Айбатшин — показывает, что все они образованы от одного корня, но различаются по способу оформления: суффиксы -ов, -ский, -шин указывают на разную языковую среду и время фиксации. Фамилия Айбатов — самая распространённая и простая по модели, что говорит о её раннем и массовом появлении среди оседлого населения.