Фамилия Айдаркин образована от прозвища Айдарка. Скорее всего, в его основе лежит существительное «айдар», значение которого В.И. Даль в «Толковом словаре живого великорусского языка» определяет как «круглая казачья стрижка под чуб». Исходя из этого, можно предположить, что Айдаркой называли человека, носящего такую стрижку. Не исключено, что такое прозвище носил местный цирюльник. В этом случае прозвище относилось к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Менее вероятной представляется связь фамилии Айдаркин с мусульманским мужским именем Айдар, казахскому варианту арабского имени Хайдар, что означает «лев». В противном случае фамилия звучала бы как Айдаров. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Айдарка, со временем получил фамилию Айдаркин.