Фамилия Айдаркожина устроена так, что её разбор сразу показывает встречу двух языковых традиций. Тюркское составное имя Айдаркожа легло в основу, а русский суффикс -ин добавил значение принадлежности: Айдаркожин — «чей?» — потомок Айдаркожи. Окончание -а указывает на женскую форму фамилии, мужская — Айдаркожин. В этом смысле фамилия ничем не отличается от тысяч других, образованных от личных имён по той же модели: Иван — Иванов, Айдаркожа — Айдаркожин.

Само имя Айдаркожа составное, и каждая его часть заслуживает отдельного внимания. «Айдар» в тюркских языках — это «чуб», «хохолок», прядь волос, которую в старину оставляли на бритой голове мальчика. Иногда это слово связывали с луной (ай), придавая имени дополнительный оттенок «светлый» или «заметный». Вторая часть — «кожа» — это казахская адаптация арабского «ходжа»: так называли потомков пророка Мухаммеда, а шире — любого уважаемого человека, наставника или грамотного книжника, часто из духовного сословия. Составное имя Айдаркожа, таким образом, могло быть дано человеку, который либо сам носил айдар и происходил из рода ходжей, либо получил это имя в честь предка, сочетавшего оба признака.

География фамилии предсказуема: она встречается преимущественно в Казахстане, а в России — в Оренбургской и Астраханской областях, то есть в регионах с давним казахским населением. В русскоязычных документах форма с суффиксом -ин и окончанием -а стала стандартной, хотя встречаются варианты Айдарходжин, Айдаркожин, а также патронимическая форма Айдарулы.

Сословный состав носителей неоднороден. Если предки действительно были ходжами, фамилия могла указывать на принадлежность к степной аристократии или духовенству. Но нередко имя Айдаркожа давали и простым кочевникам в честь уважаемого старшего родственника, так что прямого указания на высокий статус фамилия не даёт. Главное, что она сообщает: её основа — не прозвище по ремеслу или месту жительства, а личное имя, в котором сплелись и внешняя примета (чуб), и социальный маркер (ходжа).