Фамилия Бабанькова — женская форма фамилии Бабаньков, которая образована от прозвища или имени Бабанька. В русском языке суффикс -к- в основе указывает на уменьшительно-ласкательную или уничижительную форму, а суффикс -ов- (в мужском варианте) — на принадлежность: буквально «сын Бабаньки» или «человек из рода Бабаньки». Основа фамилии восходит к слову «бабаня» или «бабанька» — в южнорусских и украинских говорах так ласково называли бабушку, пожилую женщину, а иногда и просто женщину вообще. Но есть и другая, менее очевидная версия: в некоторых диалектах «бабанька» могло быть прозвищем медлительного, ворчливого или капризного человека (от глагола «бабанить» — нянчиться, возиться).

С географической точки зрения фамилия Бабаньков (и Бабанькова) встречается преимущественно в регионах, где исторически смешивались русские и украинские говоры: в Белгородской, Курской, Воронежской областях, а также на Кубани. Это объясняется тем, что суффикс -к- в основе (Баба-нь-к-а) типичен для украинской и южнорусской антропонимии, где он служил для образования семейных прозвищ. В северных и центральных областях России предпочли бы форму Бабанов или Бабушкин.

Если рассматривать фамилию в контексте социального происхождения, то носители этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или мещанами. В документах XVIII–XIX веков фамилии на -ов/-ев с уменьшительными основами часто фиксировали за однодворцами (государственными крестьянами южных окраин) или за казаками — в реестрах Войска Донского встречаются похожие прозвища. Дворянских родов с фамилией Бабаньков в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» не значится.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на второй слог (Бабанькова), так и на первый (Бабанькова). Второй вариант встречается реже и указывает на то, что в основе лежало не «бабаня», а «баба» с суффиксом -аньк-, что характерно для псковских и новгородских говоров. Но для большинства носителей фамилии ударение стоит на втором слоге, что подтверждает связь с украинским произношением слова «бабаня».