Фамилия Бабуинов — редкий случай, когда основа сразу бросается в глаза и вызывает улыбку. На слух она совпадает с названием крупной африканской обезьяны, но к зоологии её происхождение прямого отношения не имеет. В русской ономастике фамилии, образованные от названий животных, обычно несут прозвищный характер: Медведев, Волков, Зайцев. Однако «бабуин» — слово книжное, заимствованное из французского (babouin) через научную литературу, и в народной среде XVI–XVII веков, когда формировалась масса русских фамилий, оно просто не бытовало. Поэтому первая и самая правдоподобная версия — переосмысление другой, более старой основы.

Скорее всего, в основе лежит прозвище или мирское имя Бабуня. В русских говорах «бабуня» — ласковое обращение к бабушке, пожилой женщине, а также к повитухе. От него образовалась фамилия Бабунин (через суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Бабунин). А Бабуинов — это уже более поздняя, возможно, канцелярская или диалектная трансформация: суффикс -ов вместо -ин, либо искажение на письме под влиянием «учёного» слова. Второй вариант: основа «бабуй» — в некоторых северных и сибирских говорах так называли болтуна, пустомелю, человека, который «бабушкует» (пустословит). Тогда Бабуинов — «сын Бабуя», то есть потомок болтуна или ворчуна.

Словообразовательная модель здесь двойственная. Суффикс -ов типичен для фамилий от основ на твёрдый согласный (Бабуин → Бабуинов — редкий случай, когда основа уже содержит -ин). По сути, это вторичная фамилия, отфамильная: сначала был Бабунин, а потом, при переписи или смене паспорта, буква «н» могла удвоиться или замениться на -ов, чтобы звучало «солиднее». Такие примеры известны: от фамилии Губин возникали Губиновы, от Рощин — Рощиновы.

Географически фамилия почти не встречается. В дореволюционных списках и современных базах данных она единична. Это говорит о том, что её носители — либо потомки одного рода, либо результат позднего искусственного образования (например, в семинарской среде, где давали фамилии по экзотическим животным, но это маловероятно — семинаристы чаще брали греческие и латинские корни). Более реалистично: предок носителя мог получить прозвище Бабуня или Бабуй в какой-нибудь деревне Вологодской или Архангельской губернии, а при записи в метрическую книгу писарь, слышавший про бабуинов, записал на свой лад. Так фамилия и закрепилась.

Итог простой: Бабуинов — не про обезьян, а про бабушку, повитуху или болтуна. Это пример того, как случайное созвучие с иностранным словом перекрывает исконный русский корень.