Фамилия Бадовская образована по типичной для восточнославянских фамилий модели с суффиксом -ск-, указывающим на принадлежность к местности или роду. Основа здесь — Бадов-, а суффикс -ск- превращает её в притяжательное прилагательное женского рода. Мужской вариант — Бадовский. Такие фамилии чаще всего носили дворяне, шляхта или духовенство, но со временем они распространились и среди крестьян, особенно в западных регионах.

Корень этой фамилии, скорее всего, происходит от прозвища или нецерковного имени Бад. В русских говорах слово «бад» или «бада» могло означать упрямого, своенравного человека, иногда — колдуна или знахаря (от диалектного «бадить» — ворожить, колдовать). В польском языке badacz — исследователь, а badać — исследовать, изучать, что тоже могло стать источником прозвища для пытливого или дотошного человека. В украинском и белорусском языках «бадзяцца» означает слоняться без дела, бродить, так что прозвище Бада мог получить бродяга или непоседа.

Версия о связи с географическим названием менее вероятна, но возможна: существовали села Бадово (например, в Польше или на Волыни), и фамилия могла указывать на выходца оттуда. Однако суффикс -ск- в сочетании с основой без топонимического суффикса (-овск-) чаще встречается в фамилиях, образованных от личных имён или прозвищ.

Суффикс -ск- в фамилии Бадовская типичен для польской шляхетской традиции, но в XIX веке такие фамилии активно давались и бывшим униатским священникам, и крестьянам при переходе в православие. Поэтому однозначно определить сословие предков носителя фамилии без генеалогического исследования невозможно. Скорее всего, фамилия либо польского происхождения (от прозвища Бад), либо украинского или белорусского, где -ск- фамилии часто закреплялись за священническими родами.