Фамилия Бадышева — женская форма фамилии Бадышев. В её основе лежит мужское прозвище или некалендарное имя Бадыш. Оно восходит к киргизскому слову «бадыша», что означает «падишах» или «царь». Такое имя могли дать в тюркоязычной среде: либо как пожелание ребёнку величия и власти, либо как прозвище человеку с властным, гордым характером.

Слово «бадыша» — это фонетический вариант персидского «падишах», который через тюркские языки (киргизский, казахский, татарский) вошёл в обиход. Встречаются и родственные фамилии: Бадышев, Бадышов, Бадыш. Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Бады́шева, хотя в разных регионах возможны варианты.

Формант -ев указывает на русскую модель образования фамилий: суффикс добавляли к основе, оканчивающейся на мягкий согласный или -й. В данном случае — к имени Бадыш. Такие фамилии обычно закреплялись в XVI–XIX веках, когда крестьяне и горожане получали фамилии по имени или прозвищу отца. Значит, предок носительницы фамилии мог быть человеком по имени Бадыш, а его дети стали Бадышевыми.

География фамилии тяготеет к регионам с тюркским населением: Поволжье, Урал, Западная Сибирь, а также юг России. Встречается она и у татар, и у башкир, и у русских, живших в смешанных областях. Окончательно установить точное место и время возникновения рода можно только на основе генеалогических исследований — переписей, метрических книг или ревизских сказок.

Стоит отметить, что слово «бадыша» могло быть не только именем, но и прозвищем. В тюркской традиции так называли не только правителей, но и людей, которые вели себя по-царски — например, богатых или влиятельных старейшин. Поэтому предок Бадышевых мог быть не просто носителем имени, а человеком, получившим такое прозвище за свой нрав или социальное положение.