Фамилия Багуля — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с растением, но не с тем, о котором можно подумать сразу. Вопреки ожиданию, корень здесь не от «багульника» — болотного кустарника с дурманящим запахом. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «багуля» или «багула» — это местное название можжевельника. Человек мог получить такое прозвище за схожесть с этим деревом: за живучесть, колючий нрав, или же за то, что жил в местности, густо поросшей можжевельником. Вторая, менее вероятная версия, отсылает к диалектному глаголу «багулить» — баловать, шалить, но она плохо подтверждается словарями.

Суффикс -я в фамилии указывает, что перед нами не типичная «дворянская» модель на -ов/-ин, а скорее прозвищная фамилия, оформленная по народной модели. Такие фамилии часто закреплялись за одним человеком и передавались детям без изменений, особенно в среде крестьян и казаков. Географически фамилия Багуля встречается в основном в Сибири и на Урале, где можжевельник (багуля) был обычным растением, а также в Беларуси, где «багуля» — одно из народных названий багульника болотного. В белорусском контексте фамилия могла возникнуть как прозвище знахаря или человека, жившего возле болот.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: у неё нет патронимического суффикса, который превращал бы имя отца в фамилию. Это «чистое» прозвище, которое стало фамилией. Сравните с однокоренными, но более поздними образованиями: Багульников, Багульский — они явно вторичны и возникли уже в канцелярской среде, когда чиновники «облагораживали» народные прозвища. Багуля же осталась в исходной, архаичной форме, что говорит о её давнем бытовании в крестьянской среде, где фамилии закрепились раньше, чем в центральных губерниях.

Таким образом, предки носителя фамилии Багуля с высокой вероятностью жили в лесной или болотистой местности, возможно, занимались сбором дикоросов или знахарством. Фамилия не несёт сословной окраски — она из народной толщи, и её корень уходит в живую диалектную речь, а не в книжные святцы.