Фамилия Багышев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Багышев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Багышев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Багышев образована от древнетюркско-татарского мужского имени Багыш, которое имеет два перевода: «лось, олень» (сохранилось в в названиях родов) и «уход, попечение, забота» — в этом значении имя давалось с пожеланием, чтобы ребенок (мальчик) заботился о своих родителях в старости. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Багышев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Багышев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.