Фамилия Баканиев — редкий пример, где за привычной русской фамильной формой скрывается нерусская, скорее всего тюркская, основа. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать слово по частям, и здесь есть интрига.

Фамилия образована с помощью типичного русского суффикса принадлежности -ев, который присоединяют к основе, оканчивающейся на мягкий согласный. Основа — Баканий. А вот что такое «Баканий» — вопрос. Скорее всего, это русифицированная форма тюркского имени или прозвища. Например, у народов Кавказа и Поволжья распространено имя Бакан (или Бакай), которое может означать «крепкий», «устойчивый» или восходить к названию дерева (бакан — вид клёна). Суффикс -ий в данном случае — адаптация к русскому языку, превратившая имя Бакан в прилагательное «Баканий» (чей? — Баканиев).

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским словом «бакан» в значении «столб», «шест», «веха». В таком случае прозвище Баканий могли дать высокому, прямому, как жердь, человеку. Однако первая версия (от личного имени) выглядит предпочтительнее, поскольку фамилии от имён — самый массовый пласт в русской ономастике.

Географически фамилия Баканиев, судя по скудным данным, тяготеет к регионам смешанного русско-тюркского населения — возможно, к Нижнему Поволжью, Приуралью или Северному Кавказу. Встречается она крайне редко, что говорит о её локальном происхождении: возможно, родоначальник был единственным носителем такого прозвища в своей волости.

Что касается сословной принадлежности, то однозначно сказать нельзя. Такая фамилия могла появиться и у крестьянина, и у казака, и у отставного солдата, получившего землю. Важно другое: в отличие от фамилий от крестильных имён (Иванов, Петров), Баканиев — маркер этнического смешения или, как минимум, тесных контактов с тюркоязычными соседями, что было обычным делом на южных и восточных окраинах России.