Фамилия Баланенко — типичный пример украинской модели образования, где суффикс -енко указывает на прямое родство: «сын Балана» или «потомок Балана». Это самый распространённый способ создания фамилий в Украине, особенно в Левобережье и на Слобожанщине, где суффикс -енко со временем вытеснил другие формы.

Основа фамилии — прозвище Балан. В малороссийских говорах так называли чурбан, обрезок бревна или короткую балку. Слово это звукоподражательное, от «бала» — звук удара тяжёлым предметом, отсюда же и «балада», и «баламутить». Когда прозвище переносили на человека, оно чаще всего означало «низкорослый, полный мужчина» — то есть человек плотный, коренастый, похожий на короткое бревно.

Встречается и другая версия: Балан — вариант имени Бала (Балтазар или Валаам) в народной речи, но она менее убедительна. Во-первых, имя Балтазар было редким в украинской среде, во-вторых, слово «балан» с конкретным бытовым значением зафиксировано в диалектах, и прозвища по внешности давали гораздо чаще, чем по календарным именам.

Фамилия Баланенко не относится к дворянским или казацким старшинам — скорее к крестьянским или мещанским. Географически она встречается преимущественно в центральных и восточных областях Украины: Черкасской, Полтавской, Харьковской, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и Дону. В России фамилия редкая, чаще всего её носители — выходцы из Украины по мужской линии.