Фамилия Бальчайтес — редкий случай, когда русская по форме фамилия имеет литовское происхождение, причём не только по корню, но и по суффиксу. Окончание -айтис (-aitis) — типичный литовский патронимический суффикс, указывающий на происхождение от отца. Если убрать русское окончание -ес (которое появилось при адаптации фамилии в русской среде, возможно, через польское посредство), получится основа Бальч-айтис. Это значит «сын Бальчюса» или «потомок Бальчюса». Само имя Бальчюс (Balčius) — уменьшительная форма от Балис (Balys), которое, в свою очередь, является литовским вариантом имени Болеслав или, реже, Балтазар. В основе лежит корень balt- (белый) или bal- (хороший, добрый), характерный для балтийской антропонимии.

Таким образом, человек с фамилией Бальчайтес — это потомок некоего Бальчюса, жившего, скорее всего, на территории современных Литвы или Западной Беларуси. Фамилия могла оформиться в XIX веке, когда после отмены крепостного права литовским крестьянам массово присваивали фамилии по отцу. Русская приставка -ес (вместо литовского -is) в окончании — следствие того, что фамилию записывал русский чиновник или польский писарь, передававший литовское произношение на свой лад. В самой Литве фамилия звучала бы как Balčaitis, а в польской записи — как Balczajtis или Balczajtes.

Сословно носители фамилии почти наверняка были крестьянами или мелкими шляхтичами (однодворцами) на территории бывшего Великого княжества Литовского. Географически фамилия тяготеет к северо-западу современной Беларуси (Гродненская область) и юго-востоку Литвы (Вильнюсский край). Встречается она крайне редко, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если вы Бальчайтес, ваши предки с высокой вероятностью жили в одном из приходов Лидского или Ошмянского уездов.