Фамилия Балышев в своей основе имеет не церковное, а мирское имя Балаш. Чаще всего его выводят из тюркского «балаш» — «дитятко, сыночек». Это ласковое прозвище могли дать младшему ребёнку в семье или просто любимому сыну. Встречается и другая версия: имя могло восходить к тюркскому «балас» — «драгоценный камень», но лингвисты считают её менее вероятной из-за фонетического расхождения.

Модель образования типична для русской ономастики: суффикс -ев присоединяется к основе на шипящий (Балаш → Балышев). Ударение в фамилии чаще всего падает на первый слог, хотя в некоторых говорах встречается вариант Балы́шев. В старых документах фамилию могли записать через «о» — Болышев, что связано с аканьем, но эта форма не прижилась.

В русских говорах слово «балыш» иногда употребляли в значении «баловник, шалун» (от глагола «баловаться»). Однако эту версию стоит рассматривать как народную этимологию: исконное значение имени уходит корнями в тюркские языки, а не в славянскую лексику.

Географически фамилия встречается в центральных и южных регионах России, особенно в тех областях, где исторически были сильны контакты с тюркоязычным населением — в Поволжье и Приуралье. В некоторых переписях XVII–XVIII веков Балышевы записаны как служилые люди и крестьяне, но единого сословного «гнезда» у фамилии нет.

Таким образом, Балышев — фамилия с тюркским корнем, которая прошла через русскую словообразовательную модель и закрепилась в нескольких регионах. Потомки человека по имени Балаш, со временем получившие эту фамилию, могут связывать её происхождение с ласковым прозвищем младшего или любимого сына.