Основой фамилии Банаков послужило имя Банак. Имя Банак, предположительно, является производной формой крестильного имени Урбан, которое представляет собой диалектный вариант имени Урван. В свою очередь, имя Урван происходит из латинского языка, где оно имеет значение «городской, вежливый». В истории православной религии наиболее известен святой мученик Урван, живший в VI веке. Урван пострадал за веру во Христа: вместе с другими мучениками он был потоплен в море на зажженном корабле. День памяти святого мученика Урвана приходится на 5 сентября. По другой версии, фамилия Банаков происходит от прозвища Банак, которое этимологически связано с армянским существительным «банак», имеющим значение «армия, лагерь». Вероятно, прозвище Банак могло принадлежать мужественному, физически крепкому человеку. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Банак, со временем получил фамилию Банаков.