Фамилия Баньдюкова — женская форма фамилии Баньдюков, и её разбор стоит начать с неочевидного, но ключевого вопроса: откуда взялось сочетание «-дюк-», которое режет глаз русскому уху. В русской ономастике суффикс -юк характерен для украинских и белорусских фамилий (Бондарюк, Ковалюк), где он указывает на потомка или принадлежность. Но здесь основа не «Банд-», а «Бань-» с мягким знаком, что встречается реже. Скорее всего, исходное прозвище или имя — Баньдюк, где корень «Бань-» может восходить к диалектному «баня» (купальня, мыльня) или к глаголу «банить» — в некоторых говорах «мыть, парить». Второй элемент «-дюк» — это, вероятно, результат сращения с другим корнем, например, с «дюк» (в южнорусских говорах — «тучный, здоровый» или искажённое «дюжий»). Получается, что Баньдюк — это прозвище человека, связанного с баней (банщик, парильщик) и при этом крепкого, сильного, или же просто «банный детина».

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: прозвище на -юк → фамилия на -ов/-ев. Суффикс -ов в мужской форме Баньдюков указывает на принадлежность: «сын Баньдюка». Женская форма Баньдюкова закрепилась через брак или наследование от отца. Фамилия редкая, и её география, скорее всего, связана с южнорусскими или украинскими регионами, где активно использовался суффикс -юк. В центральных и северных областях России такое окончание встречается реже, поэтому носители фамилии, вероятно, происходят из Черноземья, Слобожанщины или Западной Украины.

Словообразовательная модель нестандартна: мягкий знак перед -дюк- — это следствие палатализации (смягчения) корня «бан-» под влиянием последующего звука. Встречаются однокоренные фамилии Баньков, Банников, Банюк, но Баньдюков стоит особняком из-за вставного -д-. Этот звук мог возникнуть как протетический (вставной) для удобства произношения: «Банюк» → «Баньдюк» через добавление -д- между мягким н и гласным, как в диалектных формах «индюк» вместо «инюк». Версия с украинским влиянием тоже правдоподобна: в украинском языке сочетание «ньд» встречается чаще, чем в русском (например, «деньги» — «гроші», но есть «день» — «день»).

Сословная принадлежность предков Баньдюковых, скорее всего, крестьянская или казачья. Фамилии на -юк редко встречались у дворянства, которое предпочитало модели на -ский/-цкий. Носители прозвища Баньдюк могли быть банщиками, содержателями общественных бань или просто людьми, жившими у бани. В казачьей среде прозвища часто отражали бытовые черты, поэтому банщик-силач — вполне реальный образ.

В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова фамилия Баньдюков не упоминается как отдельная статья, что подтверждает её редкость. Однако типичные модели и корни позволяют реконструировать происхождение без натяжек. Итог: фамилия Баньдюкова происходит от прозвища Баньдюк, которое, вероятно, означало «банщик» или «крепкий парень из бани», и закрепилась в южнорусских или украинских землях в XVIII–XIX веках.