Фамилия Бандюковы — один из тех случаев, когда внешне неблагозвучная основа скрывает за собой не столько криминальный подтекст (от слова «бандит»), сколько старинное диалектное прозвище. Вопреки интуитивному сближению с «бандой», корень здесь, скорее всего, чисто славянский, связанный с глаголом «бандать».

В псковских и тверских говорах «бандать» означало сразу несколько неприятных вещей: пачкать, марать, гадить, а также мешкать, мямлить, волочить время. Прозвище Бандюк, от которого пошла фамилия, носило иронический характер. Так могли назвать либо неряху и неопрятного человека, либо, наоборот, копуша-лентяя, который «бандает» с делом. Есть и другая версия, более близкая к современному звучанию: в тех же говорах «бандить» означало «шуметь, буянить». Тогда Бандюк — это задира, скандалист, возможно, даже разбойник, но именно в крестьянском, бытовом смысле, а не в уголовном.

Менее правдоподобна гипотеза, связывающая фамилию с таджикским «банда» (раб) или тюркскими корнями. Для русской фамилии, распространенной в центральных и северо-западных областях России, такая этимология выглядит искусственной и не подкреплена географией бытования.

Фамилия образована по стандартной модели: к основе прозвища (Бандюк) добавился типичный русский суффикс принадлежности -ов. Суффикс указывает на патронимический характер фамилии: Бандюков — это сын Бандюка. Форма множественного числа (Бандюковы) в данном контексте используется для обозначения всего рода, семьи.

О точном месте возникновения фамилии говорить сложно, но по говорам, где зафиксирован глагол «бандать», можно предположить, что её корни — на Псковщине или в Тверской губернии. В отличие от многих других прозвищных фамилий, которые со временем облагородились, Бандюковы сохранили прямую, диалектную, а потому особо ценную для историка языка связь с живой народной речью. Это не просто фамилия, а застывший портрет предка — возможно, неаккуратного или сварливого, но оттого не менее живого.