Фамилия Бардынин — одна из тех русских фамилий, чьё значение теряется в многозначности исходного слова. В её основе лежит прозвище Бардыня, а оно, в свою очередь, восходит к слову «барда». Тут и кроется главная трудность: у этого слова в русских говорах было несколько совершенно разных смыслов.

Самая распространённая версия связывает прозвище с ремеслом. «Бардой» называли гущу, остававшуюся после перегонки браги. Значит, Бардыней могли прозвать человека, который варил хмельные напитки или работал на винокурне. Но это же слово в некоторых регионах значило «тесак» или «секира» — тогда прозвище мог получить мясник, лесоруб или, шире, человек, работавший с тяжёлым режущим инструментом. Третье значение «барды» — неплодородная, болотистая или каменистая почва. В этом случае прозвище давали крестьянину, чей надел земли был худым, бесплодным, или тому, кто жил на такой земле.

Есть и менее бытовая версия. Если отталкиваться не от «барды», а от слова «бард» — певец и поэт у кельтских народов, — то прозвище могло указывать на человека, связанного с музыкой или пением. Эта гипотеза выглядит менее убедительной: слово «бард» стало широко известно в русском языке довольно поздно, в XIX веке, под влиянием романтической литературы, и вряд ли могло лечь в основу старинного крестьянского прозвища. Вероятнее всего, корни фамилии — в народной речи и конкретном занятии или свойстве человека.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Бардын- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Бардыни). Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России. О точном месте и времени возникновения фамилии Бардынин сейчас говорить сложно — процесс формирования фамилий длился несколько столетий, но сама модель подсказывает, что закрепилась она не позднее XVII–XVIII веков.