Фамилия Бардышев происходит от прозвища Бардыш. В основе лежит слово «бардыш» — вариант названия бердыша, холодного оружия в виде широкого длинного топора с лезвием-полумесяцем на длинном древке. Это слово пришло в русский язык из польского (bardysz), а само оружие состояло на вооружении русской пехоты с XV по XVII век.

Особенно широко бердыш применялся в стрелецких войсках XVI века. Для стрельцов он служил не только дополнительным оружием в ближнем бою, но и подставкой — подсошником, на который опирали тяжёлое фитильное ружьё при стрельбе. У конных стрельцов и драгунов бердыши делали меньшего размера, с двумя железными кольцами на древке для погонного ремня. Вплоть до конца XVIII века бердыш оставался почетным оружием дворцовой стражи и атрибутом полицейских будочников.

Прозвище Бардыш, таким образом, относится к «профессиональным» именованиям. Оно прямо указывало на род занятий предка. Скорее всего, основатель рода Бардышевых был воином — стрельцом или стражником, для которого бердыш был привычным орудием. Суффикс -ев в фамилии указывает на принадлежность: Бардышев — это «сын Бардыша», потомок человека с таким прозвищем.

Интересно, что вариант «бардыш» вместо привычного «бердыш» — не просто искажение. В народной речи звук «е» часто заменялся на «а» (ср. «берёза» и диалектное «барёза»), а «ер» мог переходить в «ар». Такое произношение закрепилось в прозвище, а затем и в фамилии. Встречаются и однокоренные фамилии — Бердышев, Бардышев, которые могли возникнуть независимо в разных местностях, но имеют одну и ту же основу.