Фамилия Барканцев — редкий случай в русской ономастике, где суффикс и основа спорят друг с другом. Если присмотреться к окончанию -цев, то это типичный патронимический суффикс, указывающий на происхождение от отца или предка: Барканец — сын Баркана. Но вот с самим корнем «Баркан» начинается путаница. В русском языке нет распространенного имени или прозвища с таким звучанием, поэтому приходится искать параллели в соседних культурах.

Самая прямая версия — тюркская. В татарском и башкирском языках «баркан» означает «существующий», «имеющийся», а в некоторых диалектах — «крепкий», «сильный». Прозвище Баркан могли дать человеку за физическую мощь или за хозяйственную хватку: «все при нем есть». Учитывая, что на юге России и в Поволжье фамилии с тюркскими корнями не редкость, эта версия выглядит убедительно. Менее вероятно, но возможно, что основа восходит к названию барки — небольшого парусного судна. Тогда Барканец — это человек, связанный с барками: либо судовладелец, либо работник на речном транспорте. Но суффикс -ец в таком случае скорее указывал бы на жителя определенного места (например, «баркинец» — живущий у барки), а не на прямую профессию.

Интересно, что в дореволюционных метрических книгах фамилия Барканцев встречается в основном в южных губерниях — Херсонской, Екатеринославской, а также в Области Войска Донского. Это подтверждает тюркскую или, возможно, греческую версию (в греческом «варкан» — тяжелый, грубый, но через звуковое смешение «в» и «б»). География подсказывает, что предки носителей фамилии могли быть казаками или крестьянами, жившими в зоне активных контактов с татарами и ногайцами. Сама фамилия довольно редкая: по данным переписи 2010 года, в России насчитывается не более нескольких сотен человек с такой фамилией, и большинство из них до сих пор сконцентрированы на юге страны.

Словообразовательная модель — от прозвища Баркан (или имени Баркан, если оно существовало) через суффикс -ец (Барканец) и далее через -ев (Барканцев). Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — Барканцев, то есть сын Барканца. Это типичная русская модель, наложенная на нерусскую основу. Встречается также вариант написания с одной «н» — Баркацев, но он еще более редок и может быть результатом описки в документах.