Фамилия Батюшкин образована от прозвища Батюшка. В основе лежит слово, которое в русском языке имело несколько значений, и это породило разные версии происхождения фамилии.

Самое прямое значение — ласковое обращение к отцу или старшему мужчине в семье. Батюшкой могли называть уважаемого, мудрого старика. В этом случае прозвище указывало на семейный статус или личные качества человека.

Вторая версия связывает фамилию с церковной средой. В деревнях священника часто называли «батя» или «батюшка». Сын попа, а иногда и сам священнослужитель, мог получить такое прозвище, которое затем закрепилось как фамилия. Эта версия выглядит правдоподобной, так как фамилии, образованные от названий духовного звания или обращения к нему, не редкость.

Есть и третья, менее распространенная версия. В сибирских говорах слово «батяня» означало не только отца, но и «брата» или «приятеля, товарища». В таком случае прозвище Батюшка могло принадлежать старшему брату или верному другу.

Фамилия образована по стандартной русской модели с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность: «чей сын?» — Батюшкин, то есть сын Батюшки. По своему строению она типична для фамилий, возникших в среде крестьян и мещан, где прозвища часто переходили в фамилии без изменений.

Ударение в фамилии обычно падает на первый слог — Бáтюшкин. Встречается она повсеместно, но особенно часто в регионах, где были сильны старообрядческие традиции, сохранявшие архаичные формы обращения.