Фамилия Бекенина — женская форма, а её мужской вариант — Бекенин. Эта фамилия образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин, который указывает на принадлежность. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Бекеня. Что означало это слово — вопрос, который ведёт к нескольким версиям.

Самая вероятная версия связана с диалектным словом «бекень» — так в некоторых русских говорах называли сдобную лепёшку или пирожок. В этом случае прозвище Бекеня мог получить любитель выпечки, либо, что встречается реже, человек, который её пёк и продавал. Прозвища по еде были обычны для крестьянской среды: они не несли оскорбительного смысла, а скорее описывали характерную черту или привычку.

Менее популярная гипотеза выводит основу из тюркских языков, где «бек» означает «господин» или «князь». Однако суффикс -еня для русских фамилий, образованных от тюркских корней, нетипичен. Чаще встречаются формы вроде Беков или Бекетов. Поэтому версия с лепёшкой выглядит убедительнее: она опирается на живую народную лексику, а не на притянутое заимствование.

Географически фамилия Бекенин (и Бекенина) встречается в основном в центральных регионах России, в частности в бывших Рязанской и Тамбовской губерниях. Там же фиксируются однокоренные фамилии — Бекенев, Бекентьев. Все они восходят к одному и тому же прозвищному корню, что подтверждает его русское, а не иноязычное происхождение.

Таким образом, предок носителей фамилии Бекенина, скорее всего, был простым человеком, получившим прозвище по кулинарной привязанности или ремеслу. Фамилия не дворянская, не редкая, но с прозрачной и живой этимологией, которая хорошо вписывается в картину русских народных имён.