Фамилия Бенар — редкий для России случай, когда фамилия пришла не из крестьянской или купеческой среды, а из французского языка, причём, скорее всего, не напрямую, а через польское или немецкое посредничество. В исконно русском именослове такой основы нет, искать корни в славянских прозвищах или древнерусских именах здесь бесполезно.

Самая вероятная версия — происхождение от французского личного имени Bernard (Бернар). В русском языке имя Бернар через западное произношение могло преобразоваться в Бенар: звук «р» перед «н» в потоке речи мог редуцироваться или заменяться на носовой призвук. В польском языке, где французские заимствования обрабатывались особенно активно, форма Benard или Benar встречается чаще. Фамилия могла закрепиться за потомками французских колонистов, военнопленных 1812 года, гувернёров или мастеровых, осевших в Российской империи.

Менее распространённая, но не исключённая версия — топонимическая. Во Франции есть несколько коммун с корнем Benard, Benars (например, Бенар в департаменте Эндр). Переселенец, получивший прозвище по месту выхода, мог стать Бенаром. Однако для русской ономастики такой путь редок: обычно топонимические фамилии оканчивались на -ский/-цкий, а не на согласный.

Фамилия не имеет суффикса, типичного для русского крестьянского именования (-ов, -ин). Это указывает на позднее закрепление, скорее всего, в дворянской, мещанской или интеллигентской среде, где фамилии не русифицировали, а оставляли в оригинальном звучании. Носители фамилии Бенар в дореволюционной России — это, как правило, обрусевшие выходцы из Франции, Швейцарии или польских земель, работавшие учителями, врачами, инженерами или военными.

В современной России фамилия встречается единично, преимущественно в крупных городах. Поиск по архивам может вывести на конкретную ветвь — например, на Бенаров из дворян Херсонской губернии или на польских Бенаров, записанных в метрических книгах католических приходов.