Фамилия Бербенко — характерный пример украинской фамилии, образованной при помощи патронимического суффикса -енко. В украинской ономастике этот суффикс (аналогичный русскому -ович/-евич) указывал на родство по отцу: Бербенко буквально значило «маленький Берба» или «сын Бербы». Такая модель была особенно распространена в Левобережной Украине, на Полтавщине и Черниговщине, где фамилии на -енко носили и казаки, и крестьяне, и мещане.

Основа фамилии — прозвище Берба. Его происхождение неочевидно, но наиболее вероятная версия связывает его с украинским диалектным словом «берба» — так в некоторых говорах называли низкорослого, коренастого человека, либо, по другим данным, человека с грубой, «бербенистой» (шершавой) кожей. Есть и вторая гипотеза: Берба могло быть вариантом имени Бернард или Бернгард, сокращённым в народной речи. Однако такое имя было редкостью среди православных украинцев, поэтому первая версия — от прозвища по внешности — выглядит убедительнее.

Бербенко — фамилия нечастая, но не уникальная. Её носители встречаются преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев в России и Казахстане. В документах XVII–XVIII веков, например в реестрах Запорожского войска, можно найти схожие прозвища (Берба, Бербениця), что подтверждает давнее бытование этой основы в казацкой среде.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить картину. Бербенко — «сын Бербы», а вот Берба — это уже прямая форма прозвища, без суффикса. Фамилия Бербенко, таким образом, закрепилась за потомками конкретного человека по прозвищу Берба, и со временем потеряла прямую связь с исходным значением, став просто родовым именем.