Фамилия Бердыбаев имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Бердыбаев уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Бердыбаев являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Бердыбаев образована от тюркского мужского имени Бердыбай, которое восходит к двум основам. Первая из них ведет свое начало от имени Берди, которое означает «он (Бог) дал». Вторая часть имени, «бай», переводится на русский язык как «хозяин, богатый, состоятельный, могущественный человек, господин». Соответственно, имя Бердыбай имеет значение «Бог дал мальчика, бая». Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Бердыбаев способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Бердыбаев представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.